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勤怠管理システムのおすすめ7選|選び方・費用・導入手順を比較

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勤怠管理システムのおすすめ7選|選び方・費用・導入手順を比較

2026年10月01日

紙のタイムカードやExcelで勤怠を管理していると、打刻データの回収、残業時間の集計、休暇残数の確認、給与計算への転記に多くの時間がかかります。クラウド型の勤怠管理システムを導入すれば、打刻から申請・承認、集計までを一元化し、管理者が労働時間の状況を早めに把握しやすくなります。

ただし、製品によって対応できる勤務形態、打刻方法、給与システムとの連携、初期設定の支援範囲は異なります。標準機能で運用できる企業もあれば、独自の就業ルールや基幹システム連携のために個別開発が必要な企業もあります。本記事では、代表的なクラウド製品と、個別開発・客観ログによる補完を相談できる企業を紹介し、選び方や導入手順を解説します。

※本記事は当社独自の基準に基づき作成・編集しており、【プロベルおすすめ】と記載があるものは、プロベル有料掲載社のプロモーションが含まれます。

勤怠管理システムのおすすめ7選

勤怠管理を短期間で標準化したい場合は、打刻・集計・休暇・申請承認を備えたクラウド製品が第一候補です。一方、既製品に合わせると例外処理が多く残る企業や、既存の基幹システムへ深く組み込みたい企業は、個別開発も比較対象になります。PC操作ログは一般的な打刻システムの代替ではありませんが、申告された時刻と勤務実態の差を確認する補完手段として役立ちます。

サービス・企業名提供形態向いている企業
株式会社SP【プロベルおすすめ】個別開発独自の就業ルールや基幹連携を重視する企業
みえるクラウド® ログ/セブンセンスマーケティング株式会社【プロベルおすすめ】PC操作ログ客観ログで勤務実態を補完したい企業
株式会社アイビス(Swooo)【プロベルおすすめ】ノーコード・AI活用の個別開発標準SaaSとフルスクラッチの中間案を検討したい企業
KING OF TIMEクラウド勤怠打刻方法と勤務設定の幅を重視する企業
ジョブカン勤怠管理クラウド勤怠シフトや工数を含め必要機能を組み合わせたい企業
マネーフォワード クラウド勤怠人事労務統合型給与・会計との連携を重視する企業
Touch On Timeクラウド勤怠専用端末を含む打刻手段と勤怠特化の運用を重視する企業

株式会社SP【プロベルおすすめ】

出典:株式会社SP

サービス・企業名株式会社SP
運営会社株式会社SP
提供形態個別開発・DX支援
主な打刻・取得方法要件に応じて設計
主な機能業務システム開発、クラウド・基幹連携、運用改善
料金PoC・MVOは100万円〜など。詳細は要問い合わせ

株式会社SPは、DXコンサルティングとシステム開発を提供するシステムインテグレーターです。業務システム、Web・モバイルサービス、基幹システム改修などに対応し、企画・要件整理から設計、開発、運用改善まで一貫して相談できます。プロベルのプロフィールでは、jinjer株式会社の勤怠管理・給与計算を含むプロダクトのリプレイス支援実績も紹介されています。

既製の勤怠管理システムでは再現しにくい独自の勤務区分や承認経路がある場合、現場の運用を無理に標準製品へ合わせるとExcelでの補正が残ります。同社は特定製品に限定せず、既存環境との相性を踏まえた提案を行うため、基幹システムや独自アプリと連携する勤怠基盤を構築したい企業に向いています。

筆者・監修者のおすすめポイント

既製品では吸収しにくい就業ルールや基幹連携を、要件整理から開発・運用までまとめて相談したい企業の候補です。勤怠領域を含むHRサービスの大規模リプレイス支援実績があり、複雑な既存環境を段階的に刷新したい場合にも比較しやすいでしょう。

株式会社SPの詳細ページを見る

みえるクラウド® ログ/セブンセンスマーケティング株式会社【プロベルおすすめ】

出典:みえるクラウド® ログ

サービス・企業名みえるクラウド® ログ
運営会社セブンセンスマーケティング株式会社
提供形態クラウド型PC操作ログ
主な打刻・取得方法PCログの自動取得
主な機能稼働状況、作業時間、アプリ利用、隠れ残業の可視化
料金初期費用10万円、月額3万円〜(30アカウントまで、以降1アカウント月額1,000円)

みえるクラウド® ログは、従業員のPC業務を自動で記録し、作業時間やアプリ利用状況を可視化するサービスです。申告された出退勤時刻だけでは見つけにくい早朝・深夜のPC利用や休日作業を把握し、隠れ残業の兆候や業務の偏りを確認できます。プロベルのプロフィールでは、初期費用10万円、月額3万円から(30アカウントまで、以降1アカウント月額1,000円)、200社以上の導入実績が紹介されています。

一般的な勤怠システムのように休暇申請や給与計算用の勤怠集計をすべて担うものではないため、役割を分けることが重要です。既存の打刻システムは維持しつつ、客観的なPCログを照合して勤務実態を補完したい企業や、リモートワークの労務リスクを把握したい企業に適しています。導入時は、取得対象、閲覧権限、従業員への説明、ログの利用目的を明確にしてください。

筆者・監修者のおすすめポイント

自己申告の打刻だけでは捉えにくいPC稼働を客観ログで補い、サービス残業や休日作業の兆候を早めに把握したい企業に向いています。勤怠集計製品の代替ではなく、既存の勤怠管理と組み合わせて実態把握の精度を上げたい場合に候補になります。

みえるクラウド® ログの詳細ページを見る

株式会社アイビス(Swooo)【プロベルおすすめ】

出典:Swooo

サービス・企業名Swooo
運営会社株式会社アイビス
提供形態ノーコード・AI活用の個別開発
主な打刻・取得方法要件に応じて設計
主な機能業務システム、独自API、既存SaaS連携
料金要問い合わせ

株式会社アイビスが運営するSwoooは、AIとノーコードを活用した新規事業開発・業務システム開発を支援しています。既製SaaSをそのまま導入するだけでなく、ノーコード基盤と独自APIを組み合わせ、企業ごとの業務フローに合わせた仕組みを構築できる点が特徴です。

店舗・拠点ごとに異なる承認、特殊な手当計算、既存データベースとの連携など、標準機能だけでは運用が複雑になる場合に検討しやすい選択肢です。フルスクラッチを前提とせず、既製SaaSで賄う領域と個別に作る領域を切り分ければ、開発範囲を抑えられます。導入前には、法改正時の保守、勤怠計算の責任範囲、データ移行、障害時のサポート条件まで合意しておきましょう。

筆者・監修者のおすすめポイント

標準SaaSでは足りないものの、すべてをフルスクラッチで開発する期間とコストは抑えたい企業に向いています。既製機能と個別開発の境界を整理し、例外処理だけを補う構成を相談したい場合に比較候補となります。

株式会社アイビス(Swooo)の詳細ページを見る

KING OF TIME

出典:KING OF TIME

サービス・企業名KING OF TIME
運営会社株式会社ヒューマンテクノロジーズ
提供形態クラウド型
主な打刻・取得方法PC、スマホ、ICカード、生体認証、入退室連携など
主な機能勤怠集計、休暇、申請承認、シフト、アラート
料金月額300円/人(税別)、初期費用0円

KING OF TIMEは、PC・スマートフォン、ICカード、指紋・顔認証、入退室連携など多様な打刻手段に対応するクラウド勤怠管理システムです。出退勤、休暇、残業の申請・承認、スケジュール、変形労働時間制などを管理でき、複数拠点や勤務形態の異なる組織でも設定を分けられます。

公式サイトでは、初期費用0円、月額300円/人(税別)、30日間の無料体験が案内されています。標準機能が広いため、打刻手段や勤務パターンが多い企業に適しています。一方、設定項目が多い製品は初期設計の良し悪しが運用品質に影響するため、代表的な勤務パターンだけでなく、夜勤、直行直帰、締め後修正などの例外も試してください。

筆者・監修者のおすすめポイント

勤務形態や打刻場所が多様で、標準機能の広さを重視する企業に向いています。自社ルールを細かく設定できる一方、導入前に計算条件を整理し、実データで結果を照合することが大切です。

ジョブカン勤怠管理

出典:ジョブカン勤怠管理

サービス・企業名ジョブカン勤怠管理
運営会社株式会社DONUTS
提供形態クラウド型
主な打刻・取得方法PC、スマホ、ICカードなど
主な機能出勤、シフト、休暇・申請、工数管理
料金月額200〜500円/人(税別、利用機能数で変動)、初期費用0円

ジョブカン勤怠管理は、出勤管理、シフト管理、休暇・申請管理、工数管理などを提供するクラウドサービスです。必要な機能を組み合わせて利用できるため、打刻と集計から始め、シフトや工数へ段階的に広げたい企業に検討しやすい製品です。PCやスマートフォン、ICカードなど複数の打刻方法を選べます。

公式資料では、利用機能数に応じて月額200〜500円/人(税別)、初期費用・サポート費用0円、最低月額2,000円と案内されています。飲食・小売・介護などシフト勤務が多い職場では、希望収集から作成、実績との突合まで確認してください。無料トライアルでは、管理者だけでなく現場の打刻や申請操作も試すと、定着しやすさを判断できます。

筆者・監修者のおすすめポイント

シフトと工数を含め、必要な管理機能を選びながら段階的に導入したい企業に向いています。自社で使わない機能を整理してから見積もると、運用と費用の両方を比較しやすくなります。

マネーフォワード クラウド勤怠

出典:マネーフォワード クラウド勤怠

サービス・企業名マネーフォワード クラウド勤怠
運営会社株式会社マネーフォワード
提供形態クラウド型
主な打刻・取得方法Web、スマホ、ICカードなど
主な機能勤怠、休暇、申請承認、アラート、給与連携
料金50名以下は法人向け基本プランと人数課金、51名以上は要見積もり

マネーフォワード クラウド勤怠は、Web・スマートフォン・ICカードなどによる打刻、勤怠集計、休暇、残業申請、ワークフロー、アラートを提供します。クラウド給与へ勤怠データを連携でき、給与計算や会計などのバックオフィス業務を同じシリーズでまとめられる点が特徴です。

公式サイトでは、50名以下向けのクラウド勤怠と、51名以上で複雑な要件に対応するクラウド勤怠Plusが案内されています。50名以下の法人向けプランは基本料金に一定人数分を含み、追加人数に従量課金が発生します。勤怠だけの月額ではなく、同じプランに含まれる会計・給与などを実際に使うかまで含め、総額と業務削減効果を比較してください。

筆者・監修者のおすすめポイント

勤怠だけでなく、給与・会計・社会保険などバックオフィス全体のデータ連携を重視する企業に向いています。現在利用中の製品と置き換える範囲を決め、重複契約が発生しないかを確認しましょう。

Touch On Time

出典:Touch On Time

サービス・企業名Touch On Time
運営会社株式会社デジジャパン
提供形態クラウド型
主な打刻・取得方法専用タイムレコーダー、PC、スマホなど
主な機能勤怠集計、休暇、申請承認、シフト管理
料金初期費用0円、月額300円/人(税別)

Touch On Timeは、勤怠管理に特化したクラウドサービスです。専用タイムレコーダーを含む複数の打刻方法に対応し、勤怠集計、残業・休暇の申請承認、シフト管理などを一元化できます。共有端末での打刻が必要な店舗や工場と、PC・スマートフォンを使うオフィスが混在する企業でも、拠点に合わせた方法を検討できます。

公式サイトでは、初期費用0円、月額300円/人(税別)、30日間の無料トライアルが案内されています。専用端末を利用する場合は別途購入費用がかかります。導入時は、端末の設置費用、通信障害時の対応、給与ソフトへのデータ出力、締め日のサポート体制を確認してください。トライアルでは、日をまたぐ勤務、休日出勤、時間単位休暇など、自社で間違いが起きやすいケースを登録し、集計結果を照合しましょう。

筆者・監修者のおすすめポイント

専用端末を含む打刻手段を用意し、勤怠管理に絞って運用したい企業に向いています。店舗や工場では、設置場所と打刻待ちが発生しない台数まで含めて試すことが重要です。

勤怠管理システムの3つのタイプ

勤怠管理システムは、解決したい範囲によって大きく3タイプに分けられます。標準機能で早く導入するか、周辺業務まで統合するか、独自要件を開発・ログで補うかを、自社の課題から選び分けましょう。

クラウド勤怠特化型

打刻、集計、休暇、申請承認、シフトといった勤怠業務をクラウド上で管理するタイプです。サーバーを自社で用意せず始めやすく、法改正に応じたアップデートをサービス側で受けられる点が利点です。標準機能に自社の運用を合わせられる場合は、短期間で紙・Excelから移行できます。

一方、製品によって変形労働時間制や複数締め日、独自手当の扱いが異なります。機能一覧に名称があるだけで判断せず、自社の計算条件を再現し、給与計算結果と一致するかを確認してください。

人事労務統合型

勤怠だけでなく、人事情報、給与、社会保険、年末調整などを同じシリーズで扱うタイプです。従業員マスターを共有できれば、入社・異動時の二重入力を減らし、勤怠から給与計算までデータをつなげやすくなります。バックオフィス全体を刷新する企業に向いています。

ただし、勤怠単体では使いやすくても、既存の会計や給与システムとの役割が重なる場合があります。どの製品を正本にするか、過去データをどこへ保存するか、退職者情報をどう保持するかまで設計してから契約しましょう。

個別開発・客観ログ補完型

独自の勤務ルール、複雑な基幹連携、現場専用アプリなどが必要な企業は、個別開発を検討します。標準SaaSを中心にし、例外処理や連携だけを個別に作る方法もあります。開発範囲を絞れば、すべてをフルスクラッチにするより期間と保守負担を抑えられます。

PC操作ログは、打刻や休暇申請を処理する勤怠システムとは目的が異なります。申告時刻と実態の差を見つける補完手段として有効ですが、取得目的と閲覧権限を定め、従業員へ説明することが欠かせません。

勤怠管理システムの選び方

比較では、機能の多さだけでなく、自社の勤務ルールを正確に再現し、現場と管理者が無理なく運用できるかを確認します。特に次の5点を実際の業務フローに沿って評価してください。

就業規則・勤務形態に対応できるか

フレックスタイム、変形労働時間制、裁量労働、夜勤、複数拠点、雇用区分ごとの締め日などを一覧にし、製品の標準設定で再現できるか確認します。ここが合わないと、システム導入後も担当者がExcelで補正し続けることになり、集計ミスや属人化が残ります。

通常勤務だけでなく、日をまたぐ勤務、休日振替、遅刻・早退、締め後の修正など、頻度は低くても計算に影響する例外をトライアルで試してください。既製品で対応できない場合は、運用を見直すか、連携・個別開発の費用を含めて判断します。

現場が使える打刻方法か

PC、スマートフォン、ICカード、生体認証、共有端末、入退室連携など、製品ごとに打刻方法が異なります。オフィス勤務ならPC、直行直帰が多いならスマートフォンとGPS、店舗・工場なら共有端末やICカードが使いやすい場合があります。

正確性だけでなく、打刻場所、端末台数、通信障害時の代替手段、打刻忘れ通知まで確認しましょう。方法が現場に合わないと代理打刻や未打刻が増え、管理者の修正負担がかえって大きくなります。

給与・人事・会計システムと連携できるか

連携先の製品名が掲載されていても、APIで自動連携できるのか、CSVの出力・取込が必要なのかで作業量は変わります。従業員ID、勤怠項目、締め日、丸め設定が一致せず、毎月ファイルを加工するケースもあります。

月次業務を打刻から給与確定まで通して確認し、どこに手作業が残るかを洗い出してください。将来システムを変更する可能性も考え、CSV出力やAPIの仕様、データの持ち出し方法を確認しておくと移行リスクを下げられます。

導入支援と運用サポートは十分か

勤怠システムは初期設定が計算結果に直結します。就業規則の読み替え、従業員データの移行、勤務区分の登録、管理者への研修を誰が担うのか確認してください。設定代行が有料の場合は、初期費用だけでなく変更時の支援費用も見積もります。

問い合わせ手段、対応時間、締め日前後の混雑、法改正時の案内方法も比較ポイントです。担当者一人だけが設定を理解する状態を避け、社内手順書と権限のある副担当者を用意すると、異動や退職時にも運用を継続しやすくなります。

セキュリティと権限管理が要件を満たすか

勤怠データには氏名、勤務時刻、位置情報、休暇情報などが含まれます。管理者が閲覧できる範囲、操作ログ、多要素認証、通信・保存時の暗号化、データ保存場所、バックアップ、委託先管理を自社基準と照合してください。

PCログやGPSを利用する場合は、必要以上の監視にならないよう、取得対象、利用目的、保存期間、閲覧者を明確にします。従業員に事前説明し、就業規則や社内規程との整合を確認することが、導入後の不信感やトラブルを防ぎます。

勤怠管理システムを導入するメリット

適切に導入すれば、勤怠管理システムは集計作業の短縮だけでなく、労働時間の早期把握や運用の標準化にもつながります。代表的なメリットを2点に分けて解説します。

集計・給与連携の手作業を減らせる

打刻データを自動集計し、休暇・残業の申請承認と結びつけることで、紙の回収やExcelへの転記を減らせます。給与システムへ連携できれば、入力ミスや締め処理の手戻りも抑えやすくなります。担当者は単純集計ではなく、例外の確認や従業員への支援へ時間を使えます。

効果を測る際は、月末集計の時間だけでなく、打刻漏れの催促、修正申請、CSV加工、給与確定後の訂正まで含めて比較します。システム化しても例外処理が残る場合は、設定や運用ルールを見直してください。

長時間労働や打刻漏れを早めに把握できる

紙や月末集計では、長時間労働や未打刻に気づくのが締め後になりがちです。クラウド勤怠で日次集計とアラートを使えば、管理者が早い段階で従業員へ確認し、業務配分や勤務計画を調整できます。休暇取得状況も一覧化しやすくなります。

アラートを出すだけでは改善につながらないため、誰が何日以内に確認し、どの基準で上長や人事へ連絡するかを決めます。客観ログを併用する場合も、差異を自動的に不正とみなさず、本人へ事情を確認する運用が必要です。

勤怠管理システム導入の進め方

導入効果を得るには、契約前の要件整理と実データによる検証が欠かせません。現行ルールの棚卸しから段階導入まで、次の順序で進めると手戻りを抑えやすくなります。

現行ルールと例外処理を棚卸しする

最初に、勤務区分、休憩、残業、休暇、締め日、承認経路、修正方法、給与連携を業務フローにします。就業規則に定めた正式ルールと、現場で続いている慣習が異なる場合は、システムへ登録する前に人事・労務担当と整理してください。

あわせて、必須要件と変更可能な運用を分けます。すべての現行手順をそのまま再現しようとすると、製品選択が狭まり、個別開発費が膨らみます。法令や事業上必要な要件は守りつつ、製品の標準機能へ寄せられる業務を見極めることが重要です。

実データでトライアルし段階導入する

候補を絞ったら、実際に近い従業員・勤務区分・シフトを登録し、1か月分の代表データで試します。通常勤務だけでなく、夜勤、休日出勤、欠勤、時間単位休暇、締め後修正を含め、現行の計算結果と一致するか確認してください。

一部部署や拠点で先行導入し、打刻忘れ、問い合わせ、承認の滞留、給与連携の手戻りを記録します。問題を修正してから全社展開すると、混乱を抑えられます。運用開始後も、アラート件数や締め処理時間を定期的に確認し、設定を改善しましょう。

勤怠管理システム選びでお悩みならプロベルへご相談ください

勤怠管理システムは、価格や知名度だけでなく、自社の勤務形態、打刻環境、給与・人事システムとの連携、導入支援、セキュリティを基準に比較することが重要です。標準的な運用であればクラウド勤怠を短期間で導入できますが、独自の承認や基幹連携が多い場合は、個別開発や既製SaaSとの組み合わせも候補になります。

依頼前には、①従業員数と拠点、②勤務形態と例外処理、③希望する打刻方法、④連携先のシステム、⑤予算と導入時期を整理しておくと、候補を比較しやすくなります。PCログを利用する場合は、利用目的と閲覧権限も明確にしてください。

自社だけで要件を整理し、クラウド製品と個別開発のどちらが適切か判断するのが難しい場合は、プロベルへご相談ください。課題と条件に合う専門家を比較し、相談先を探せます。

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